Laboratórium genetických analýz
Infraštruktúra
Termocyklér
Sekvenátor druhej generácie
Real Time Termocyklér
PCR box
Microarray systém
Vedeckovýskumné činnosti laboratória
- Realizácia výskumu v oblasti izolácie prolamínových bielkovín z rôznych druhov cereálií, hydrolýza izolovaných prolamínových bielkovín pomocou špecifických syntetických enzýmov mikrobiálneho pôvodu (metaloproteinázy a serínové proteinázy z rodu Bacillus a Streptomyces), imunochemická analýza hydrolyzovaných produktov cereálnych bielkovín pomocou sandwichovej ELISA metódy s použitím komerčného kitu Agra Quant Gluten na báze protilátky G12,
- príprava metodického postupu transkriptomickej analýzy NGS metodikou,
- príprava RT-PCR analýz pre mikrobiologické skúšanie potravín a analýzy alergénov potravinových zdrojov,
- príprava knižnice modelových vzoriek,
- syntéza cDNA molekúl, validácia a kvantifikácia vzoriek na NGS s využitím termocykléra Tprofessional Basic Gradient XL (Biometra), nasledovať bude sekvenovanie (spolupracovali doc. Žiarovská, Ing. Medo, RNDr. Fialková a Mgr. Bilčíková),
- nastavovanie a optimalizácia programov teplotných podmienok, stanovenie polymorfizmov pomocou kvantitatívnej polymerázovej reťazovej reakcie (termocyklér Tprofessional Basic Gradient XL – Biometra),
- údržba a užívateľské servisovanie (pravidelné premývanie – flow cell) sekvenátora, v roku 2018 je plánované vypnutie sekvenátora z dôvodu kontroly, servisnej prehliadky, upgrade,
- príprava vzoriek na stanovenie polymorfizmu vybraných génov (jablone), overovanie používania metodiky pomocou real-time PCR cyklér (RealTime PCR TOptical gradient 96).
Riešené projekty
VEGA 1/0163/18
Determinácia pleiotropného účinku endokrinných disruptorov a biologicky aktívnych látok v celulárnom modelovom systéme in vitro. Zodpovedný riešiteľ projektu: Ing. Zuzana Kňažická, PhD.
VEGA 2/0025/15
Endofytické mikroorganizmy a ich potenciálna úloha pri zvyšovaní tolerancie drevín voči stresu. Zodpovedný riešiteľ: Ing. Juraj Medo, PhD., Katedra mikrobiológie, FBP SPU v Nitre
COST Action FA1402
Improving Allergy Risk Assessment Strategy for new food proteins.
COST CA 15223
Modifying plants to produce interfering RNA
Publikácie
Publikácie s poďakovaním VC ABT (evidované v databáze EPCA)
Skupina A (kvantifikácia publikačnej činnosti)
Central and Eastern European spring pollen allergens and their expression analysis-state of the art / Jana Žiarovská, Lucia Zeleňáková. — ilustr., tab. — AgroBioTech 26220220180. In: Diversity. — ISSN 1424-2818. — vol. 8, no. 4 (2016), s. 1-11.
Effect of DNA extraction method in the Rosa canina L. identification under different processing temperature / [elektronický zdroj] / Jana Žiarovská .. [et al.]. — grafy, ilustr., tab. — Popis urobený 16.5.2017. — Project no. 26220220180. In: Potravinárstvo. — ISSN 1337-0960. — vol. 11, no. 1 (2017), s. 190-196, online. — 10.5219/717.
Máte záujem o spoluprácu?
Kontaktujte nás pre viac informácií o možnostiach spolupráce a výskumných projektoch.