Laboratórium genetických analýz
Infraštruktúra
Sekvenátor NGS pre celogenómové sekvenovanie
Termocyklér
Vertikálna elektroforéza so zdrojom napätia
Horizontálna elektroforéza so zdrojom napätia
Gél dokumentačný systém
Veľkokapacitná centrifúga
PCR box
Ďalšie:
- Vortex
- Termoblok
- Stanica pre izoláciu DNA
Spolupracujúce inštitúcie
- Katedra Ústav rastlinných a environmentálnych vied (FAPZ)-prof. Ing. PaedDr. Jana Žiarovská, PhD.
- Institute of Botany, Jagiellonian University in Krakow – dr hab. Aneta Słomka prof.
- Ústav záhradníctva (FZKI)-prof. Ing. Miroslava Kačániová, PhD.
- Ústav biotechnológie (FBP)- Ing. Eva Tvrdá, PhD.
- SAV Zvolen
- SAV Mlyňany
Vedeckovýskumné činnosti laboratória
- Homogenizácia rôznych rastlinných pletív.
- Realizácia a optimalizácia izolácií nukleových kyselín (DNA, RNA, miRNA) a proteínov z rôznych typov pletív a tkanív. Overovanie funkčnosti izolovaných nukleových kyselín v PCR.
- Stanovenie medziodrodového a medzidruhového polymorfizmu rastlinných vzoriek pomocou markerovacích techník (RFLP, PBA, iPBS, CDDP, BBAP, PBAP). Štúdium populačných molekulárnych charakteristík rastlinných druhov.
- Príprava vzoriek na sekvenáciu (amplifikácia vybraného úseku a následná purifikácia) so zameraním na DNA-fingerprinting a druhové odlíšenie.
- Elektroforetická separácia amplikónov vzoriek na agarózovom (AGE) alebo polyakrylamidovom (PAGE) géli a následné zobrazenie amplifikovaných oblastí pomocou gél-dokumentačného systému.
Riešené projekty
Aktuálne riešené projekty
- VEGA 1/0067/24 Včasná prevencia bakteriálnej kontaminácie v procese kryoprezervácie živočíšnych spermií (Zodpovedný riešiteľ: Ing. Eva Tvrdá, PhD.)
- 09I05-03-V02-00085 Autonómny pestovateľský systém ako potencionálny udržateľný zdroj zdravých plodín (Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Alena Andrejiová, PhD.)
- APVV-20-0058 Potenciál rastlinných silíc z aromatických rastlín na lekárske použitie a na konzerváciu potravín. (Zodpovedný riešiteľ: prof. Ing. Miroslava Kačániová, PhD.)
Úspešne ukončené projekty
- VEGA 1/0163/18 Determinácia pleiotropného účinku endokrinných disruptorov a biologicky aktívnych látok v celulárnom modelovom systéme in vitro. Zodpovedný riešiteľ projektu: Ing. Zuzana Kňažická, PhD.
- VEGA 2/0025/15 Endofytické mikroorganizmy a ich potenciálna úloha pri zvyšovaní tolerancie drevín voči stresu. Zodpovedný riešiteľ: Ing. Juraj Medo, PhD., Katedra mikrobiológie, FBP SPU v Nitre
- COST Action FA1402 Improving Allergy Risk Assessment Strategy for new food proteins.
- COST CA 15223 Modifying plants to produce interfering RNA
Publikácie
Vybrané publikácie za obdobie 2020-2024
ADC Natural Variability of Genomic Sequences of Mal d 1 Allergen in Apples as Revealed by Restriction Profiles and Homolog Polymorphism
Urbanová, Lucia — Bilčíková, Jana — Moravčíková, Dagmar — Žiarovská, Jana. In: Agronomy-Basel. 14, 2056 (2024), s. 9. ISSN 2073-4395.
ADM DNA-Based Variability of Length Polymorphism of Plant Allergens Coding Genes Homologs in Selected Lamiaceae Herbs
Urbanová, Lucia — Farkasová, Silvia — Speváková, Ivana — Kyseľ, Matúš — Šimora, Veronika — Kačániová, Miroslava — Žiarovská, Jana. Beachwood, LIDSEN Publishing Inc. (Beachwood, USA) : (2024).
AAB Charakteristika odrôd viniča hroznorodého pestovaného v oblasti Veľkého Krtíša
Žiarovská, Jana — Fikselová, Martina — Farkasová, Silvia. 1. vyd. Nitra : Slovenská poľnohospodárska univerzita, 2024. 107 s. ISBN 978-80-552-2807-5.
ADN Variability of amplified profiles generated by BBAP in Avena sativa L.
Farkasová, Silvia — Droppa, Michal — Žiarovská, Jana. In: Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences. 12, 5 (2023), s. 2023. ISSN 1338-5178.
ADD Utilization of Bet v 1 homologs based amplified profile (BBAP) variability in allergenic plants fingerprinting
Žiarovská, Jana — Urbanová, Lucia. In: Biologia. 77, 2 (2022), s. 517–523. ISSN 0006-3088.
Publikácie s poďakovaním VC ABT za obdobie 2016 a 2017 (evidované v databáze EPCA)
ADM Central and Eastern European spring pollen allergens and their expression analysis-state of the art / Jana Žiarovská, Lucia Zeleňáková. — ilustr., tab. — AgroBioTech 26220220180. In: Diversity. — ISSN 1424-2818. — vol. 8, no. 4 (2016), s. 1-11.
Effect of DNA extraction method in the Rosa canina L. identification under different processing temperature / [elektronický zdroj] / Jana Žiarovská .. [et al.]. — grafy, ilustr., tab. — Popis urobený 16.5.2017. — Project no. 26220220180. In: Potravinárstvo. — ISSN 1337-0960. — vol. 11, no. 1 (2017), s. 190-196, online. — 10.5219/717.
Máte záujem o spoluprácu?
Kontaktujte nás pre viac informácií o možnostiach spolupráce a výskumných projektoch.